FIDO 机器人 eDNA 采样器进入实地测试阶段

遗传学
FIDO Robotic eDNA Sampler Enters Field Tests
美国地质调查局 (USGS) 的 READI-Net 项目与蒙特雷湾水族馆研究所 (MBARI) 已针对 FIDO 开展了团队培训。FIDO 是一款便携式自主 eDNA 采样器,可采集并保存多达 144 份水样,用于水生生物威胁的早期监测。READI-Net 将于今年冬季开始实验室测试,并于明年夏季在溪流、船只和入侵物种通道开展更广泛的实地试验。

港口试验与生物监测新工具

2025年12月9日至10日,两台紧凑型采样机器人从小型下水点滑入 Moss Landing 港平静的水域,来自 Monterey Bay Aquarium Research Institute (MBARI) 的工作人员带领 USGS READI‑Net 的参与者进行了实地培训和部署演练。这些被称为 FIDO(Filtering Instrument for DNA Observation,DNA观测过滤仪器)的机器人旨在收集环境DNA(即鱼类、贻贝、蜗牛和其他水生生物留下的微观遗传痕迹),并将其保存以供实验室分析。U.S. Geological Survey (USGS) 于2026年1月28日宣布,此次培训是 READI‑Net 计划部署用于生物威胁早期预警的下一代 eDNA 自动采样器的首次实战测试。

DNA观测过滤仪器 (FIDO)

FIDO 的设计围绕两个互锁的目标:在提高采样通量的同时,保持系统的便携性和经济性。根据 READI‑Net 的资料,单台 FIDO 可以收集并保存多达144个离散样本;它的重量轻到可以由单人携带;支持远程控制和监测;并且其设计旨在实现相对低成本的生产。MBARI 的团队和 USGS 的合作伙伴还在 Moss Landing 的课程中制作了一份用户手册,以便在 READI‑Net 扩大测试规模时加速培训进程。

这些设计选择反映了一种运行逻辑:当能够进行高频且广泛的采样时,早期预警计划的效果最佳。传统的生物调查——如网捕、拖网、潜水调查或潜水员计数——非常耗时,且经常会遗漏低密度或隐秘的入侵者。环境DNA方法通过回收生物体排入水体、沉积物或生物膜中的微小遗传物质片段来提高灵敏度。利用 FIDO 这样的设备实现样本采集、过滤和保存的自动化,有望将这种灵敏度扩展到人力团队无法覆盖的更多时间和地点。

READI‑Net 的角色与战略

READI‑Net(快速环境 eDNA 评估与部署倡议及网络)是一项 USGS 计划,旨在支持美国内政部的“国家早期监测和快速反应框架”。该倡议开发自动化采样器、标准化采样协议和分析工具,以便资源管理人员能够设计符合当地优先事项的监测计划。在公告中,USGS 强调 READI‑Net 团队将利用 FIDO 测试来完善在各种现实环境中部署自动化采样器的方案。

计划中的试验遵循分阶段的方法。该计划将在今年冬天进行实验室测试,以验证样本处理和保存的工作流程,然后在明年夏天进行更广泛的野外测试。野外测试地点将包括固定的 USGS 河流测验站、研究船以及被确定为入侵物种走廊的区域——在这些地点进行早期拦截可以防止物种定居,并减少生态和经济损失。

eDNA 采样如何融入早期反应

环境DNA是一种强大的监测手段:即使没有直接观察到个体,从一两升水中捕获的极少量遗传物质也能揭示物种的存在。对于管理人员来说,这种灵敏度转化为在物种定居初期就发现入侵者的机会,此时进行有针对性的铲除或遏制仍然可行,且成本相对较低。

READI‑Net 团队计划使用 FIDO 收集高时间分辨率的时间序列数据(在某些部署中为每日或每小时采样),这提高了捕捉短暂或稀有信号的可能性。实时或近实时的监测还支持快速决策周期:eDNA 检测结果呈阳性可以触发确认性调查、重点清除、定向封闭或其他管理行动,从而抓住狭窄的机会之窗。

技术现实与解释的局限性

eDNA 采集的自动化并不能消除关于遗传检测实际意义的科学约束。eDNA 检测的是 DNA 片段;它们无法直接区分存活、繁殖的种群与随洋流、压舱水或附着在设备上运输的瞬时 DNA。污染导致的假阳性和因 DNA 降解或采样缺口导致的假阴性仍然是实际操作中需要关注的问题。

READI‑Net 和 MBARI 正在测试过滤、保存和监管链协议,以降低污染风险并使下游分析标准化。但将分子层面的发现转化为管理行动需要阈值和验证步骤:实验室确认、使用传统设备进行反向调查,以及生态风险评估,以确定检测到的生物是否构成迫在眉睫的威胁。

实验室通量和数据解释是另外的瓶颈。只有当实验室能够以足够快的速度处理和分析数百个自动化样本以指导行动时,收集这些样本才有意义。READI‑Net 与区域 eDNA 实验室的合作旨在使采样设计与分析能力保持一致,并开发考虑检测不确定性的决策框架。

运行挑战:部署、成本与规模

  • 物流与维护:即使是便携式采样器也需要定期维护——更换过滤器、电池充电、固件更新和去污染程序。READI‑Net 将评估野外团队访问设备的频率,以及维护工作对长期监测成本的影响。
  • 网络化监测:FIDO 设备受远程控制和监测,但在大型流域扩展到数百个采样器会带来通信基础设施、数据管理和网络安全方面的问题。
  • 标准化:为了使监测数据在不同管辖区、州和联邦合作伙伴之间具有可比性,必须统一样本量、过滤、保存和元数据收集的协议。READI‑Net 的测试阶段明确旨在建立这些共享实践。
  • 成本与生产:USGS 的发布指出,设计重点在于相对的经济性和可生产性。大规模制造、采购规则和生命周期成本将决定 FIDO 是否能成为土地管理人员和水务机构广泛分发的工具。

测试时间表与后续步骤

在12月的培训之后,READI‑Net 报告称,实验室测试将于今冬开始,以验证样本处理和保存,并计划在接下来的夏天进行扩大化的野外试验。这些测试将在各种环境中演练 FIDO,包括装有 USGS 水文站的小型支流、研究船进行的沿海监测,以及在已知的入侵走廊进行的针对性部署。这些分阶段试验的结果将决定 FIDO 是否从研究原型转变为早期监测工具箱中的运行化组件。

生态系统与管理影响

如果像 FIDO 这样的自动化采样器达到预期,管理人员可能会获得一类新型的哨兵设备,从而增加 eDNA 监测的空间和时间覆盖范围。这在多个方面都具有重要意义:防止非本土鱼类和无脊椎动物定居可以保护本土生物多样性;早期发现病原体或有害藻类暴发可以降低人类娱乐和水源供应的风险;及时的检测还可以通过避免后期昂贵的根除计划来节省公共和私人资金。

USGS 的声明强调,FIDO 的开发和测试是涉及多个 USGS 中心及其合作伙伴的协作成果,任何产品名称仅用于描述目的,不代表认可。研究人员和管理人员将密切关注即将进行的实验室和实地试验,看 FIDO 是否能将潜力转化为可靠的早期预警。

资料来源

  • U.S. Geological Survey (USGS) — READI‑Net 新闻与计划资料
  • Monterey Bay Aquarium Research Institute (MBARI) — FIDO 开发与培训资料
  • USGS 生态系统任务区
  • 北落基山科学中心 (NOROCK) — READI‑Net 协调与部署
Wendy Johnson

Wendy Johnson

Genetics and environmental science

Columbia University • New York

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Readers Questions Answered

Q 什么是 FIDO?它的主要功能有哪些?
A FIDO 是 DNA 观测过滤仪器(Filtering Instrument for DNA Observation)的缩写,是一种便携式自动化采样器,旨在从水中收集环境 DNA 并保存样本以供实验室分析。它可以收集并保存多达 144 个独立样本,重量轻到单人即可携带,支持远程控制和监测,且其设计目标是制造成本相对较低。
Q FIDO 的计划测试时间表是怎样的?
A 计划测试采用分阶段方法:实验室测试定于今年冬天进行,以验证样本处理和保存工作流程,随后将在明年夏天进行更广泛的野外测试。野外部署将包括固定的美国地质调查局(USGS)河流测流站、研究船以及被确定为入侵物种走廊的区域,以便在现实环境中完善部署方案。
Q FIDO 的 eDNA 采样如何协助早期检测和管理决策?
A 环境 DNA(eDNA)采样可以通过水中的微小遗传片段揭示物种的存在,从而实现高时间分辨率的数据收集——在某些部署中可达到每日或每小时一次。这些检测可以触发确认性调查、有针对性的清除或管理行动,但在解释结果时必须考虑到 DNA 可能反映的是活体种群或瞬时物质,且存在假阳性或假阴性的风险。
Q 部署 FIDO 和解释 eDNA 数据面临哪些挑战?
A 部署 FIDO 和解释 eDNA 结果面临多项挑战:持续的维护需求、远程操作和去污染;跨多个单元的可扩展、可靠的通信和数据管理;为确保可比性而对标准化采样方案的需求;以及实验室通量限制、污染风险、假阳性和假阴性,这些在采取管理行动前都需要验证步骤。

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